与许多动物相比，婴儿在母乳喂养期 间的 蛋白质摄入量较低。母乳中的蛋白质含量约为1克/100毫升，而蛋白质的摄入量大约为1克/千克体重/天。断奶期间的蛋白质摄入量显著增加，即使在1岁以后也是如此。尽管对蛋白质的需求量逐渐减少，但蛋白质的摄入量仍从约1克/千克体重/天增至3-4克/千克/天。尚不清楚这种现象的远期结局。高的蛋白质摄入可能会对内分泌、代谢和生理功能产生影响，并可能增加肥胖的发生风险 。

铁缺乏和缺铁性贫血一直是婴儿和儿童所面临的一个营养健康问题，尽管已经做出很大的努力来降低其发病率，但是在发展中国家情况还是比较严重的。

直至20世纪70年代中期，才发现锌也是婴儿和儿童所必需的一种营养素。与母乳喂养儿相比，配方喂养儿的头发和血清中的锌浓度较低，而且生长也较为缓慢。将配方中锌的浓度增加3倍时，配方喂养儿头发中锌的浓度则与母乳喂养儿相似，生长也得以改善。直至最近才意识到缺锌是一个全球性的健康问题。

研究表明，特定菌株可对GALT，产生免疫保护和免疫调节作用。这些作用可带来特定的临床获益，可保护机体抵御轮状病毒等病原体，减少抗生素相关性腹泻，减少过敏性疾病的发生。已有大量研究阐明了在婴儿饮食中，添加益生菌的益处和安全性；特别是在生命早期、对无免疫保护的非母乳喂养婴儿，补充益生菌可以带来更多的获益。